Tevékenységük keretét továbbra is az Országgyűlés által 2003-ban elfogadott tízéves népegészségügyi stratégia határozza meg.
Kökény Mihály hangsúlyozta: az iroda alapvető küldetése, hogy választ adjon az egészséget érintő kihívásokra. Segítse és felgyorsítsa a népegészségügyi program kiteljesítését, az egészség tekintetében érvényesülő egyenlőtlenségek csökkentését, közelítve ezzel a magyar lakosság életesélyeit az Európai Unió átlagához. Tekintettel arra, hogy az egészség nem az egészségügyben keletkezik és vész el, társadalmi és gazdasági kölcsönhatások eredőjeként javul vagy romlik a népesség egészsége. Ezért az egészségfejlesztés talpköve az ágazatköziség, a kormánymegbízott irodájának legfőbb feladata e tárcaközi tevékenységek koordinálása.
A kormánymegbízott kiemelte: tevékenységük keretét továbbra is az Országgyűlés által 2003-ban elfogadott tízéves népegészségügyi stratégia határozza meg. Ennek a programnak alapvető célkitűzése, hogy 2012-ig a születéskor várható élettartam legalább 3 évvel hosszabbodjon meg, miközben növekedik rokkantságtól és betegségtől mentes éveink száma.
Mint ismeretes, az 1142/2004. (XII. 15.) Kormányhatározat értelmében a népegészségügyi program végrehajtásának koordinálását, a tárcaközi feladatok biztosítását és a program Kormány előtti képviseletét egy esztendeje kormánymegbízott (Kökény Mihály) látja el. Kinevezésével Magyarországon a rendszerváltás óta először jutott kifejezésre az a szándék, hogy az egészségmegőrzés, az egészség szempontjainak érvényesítése túllépi az ágazati szaktárca kereteit, ez összkormányzati ügy. Az iroda ugyanis munkájával hozzájárul, hogy az egészséget támogató politikai gyakorlat terjedjen, azaz a kormányzati döntések előkészítésével az egészségre gyakorolt hatásokat gondosabban mérlegeljék.