Több pulmonológiai járóbeteg-szakrendelést is tartanak a kórház Üllői úti és Madarász utcai telephelyén.
A Heim Pál kórház vette át a pulmonológiai ellátás egy részét a bezárt Svábhegyi Gyermekgyógyintézettől, a feladathoz tizenöt ágyat biztosított az intézmény, és átvett néhány szakembert is. A pulmonológia a kórház egyik belgyógyászati osztályának keretében működik. Harmat György főigazgató szerint „dugig" vannak beteggel: a napi húsz-negyven páciens kezelése mellett több pulmonológiai járóbeteg-szakrendelést is tartanak a kórház Üllői úti és Madarász utcai telephelyén.
A Heim Pál kórház nemcsak ágyakat, hanem többletfinanszírozást sem kapott a feladat átvételekor, ezeket - mint mondta - a Semmelweis Egyetemhez rendelték, így a kórház munkájának egy részét gyakorlatilag ingyen végzi. A finanszírozás ettől függetlenül sem elég, a főigazgató időről időre fölhívja a figyelmet, hogy húsz-harminc százalékkal több beteget látnak el, mint amennyi után pénzt kapnak. A szakember úgy nyilatkozott: nem tud arról, hogy a Svábhegyi Gyermekgyógyintézet megszüntetésével zavar támadt a gyermekek tüdőgyógyászati ellátásában, hozzá nem jutott el ilyen panasz.
A svábhegyi intézmény fejlődés-neurológiai ellátással is büszkélkedhetett, ezt a János kórház egyik telephelyére, a volt Margit kórházba vitték át.