Az irritábilis bél tünet-együttes oka ismeretlen, a jelenlegi tudásunk és vizsgálataink szerint kimutatható elváltozást nem lehet találni. Azt tartják, hogy első sorban környezeti ártalommal, stresszel lehet összefüggésben, ilyen értelemben a stresszre való hajlam mint adottság, lehet örökletes tényező.